シーズン2

毛利探偵事務所にコナンの母親だと名乗る女が現れ、蘭や小五郎の手前ウソとも言えずコナンは女の車に乗り込む。しかしその女はコナンの正体が工藤新一だと知っていた——一連の「誘拐」は、新一が小さくなってしまった事を知った両親・工藤優作と有希子が「息子がどう対処するか試したい」という親心から仕組んだ大芝居だった。**工藤優作・有希子のTV初登場回**。優作は自作の主人公「ナイトバロン」の仮面で息子を試した。

堀田家の三兄弟が次々と巻き込まれる連続事件「堀田三兄弟殺人事件」。兄弟同士の確執と長男・次男・三男それぞれの立場をコナンが整理して犯人を絞り込む。

美容のための顔パックが凶器となる異色の事件「顔パック殺人事件」。日常的なアイテムを使ったトリックと、犯人の動機を、コナンが美容ルーティンから読み解く一話。

雪に閉ざされた山荘で起きるクラシックな密室「雪山山荘殺人事件」。本格ミステリーの王道シチュエーションを、初期コナンが堂々と解決する。シリーズの定型を確立した重要回。

スポーツクラブを舞台にした殺人事件「スポーツクラブ殺人事件」。トレーニング機器・ロッカールーム・プールという特殊な施設環境の中でコナンが手がかりを集める初期回。

蘭のもとへ「西の高校生探偵」服部平次が新一に会いに現れる。風邪気味のコナンに服部が中国酒を飲ませてしまい、コナンはフラフラに。そんな中、小五郎への依頼人である外交官・辻村が首筋に針を刺されて毒殺される事件が発生する。服部平次の初登場回（前編）。

服部平次が事件のトリックを暴き、犯人と思しき人物を追い詰めていく。しかし中国酒の作用で工藤新一の姿に戻ったコナンが現れ、服部の推理の誤りを指摘して真犯人と事件の真相を明かす。APTX4869に解毒効果のあるものが存在する可能性が示唆された重要回（後編）。

図書館を舞台にした殺人事件「図書館殺人事件」。静謐な空間と本の並びという独特の環境を、コナンが手がかりの宝庫として活用する初期の本格回。

ゴルフ練習場で起きた殺人事件「ゴルフ練習場殺人事件」。打球の軌道と打席の配置、客の入退場が事件解決のキーとなる、スポーツ施設ミステリー。

山深い土地に古くから伝わる「霧天狗」の伝説が残る村を訪れた毛利一家とコナン。深い霧に包まれた山中で、村人が天狗のしわざとしか思えない不可解な状況で殺害される。土俗的な妖怪伝承と現代の事件が交錯する、初期の伝説ミステリー単発SP。

凶器が特定できない異色の事件「謎の凶器殺人事件」。日常品の中に隠された武器の正体を、コナンが現場の傷の形状から逆算して導き出す初期の名作。

ゲーム会社を舞台にした殺人事件「ゲーム会社殺人事件」。新作ゲーム開発の現場で起きた事件と、プログラマーたちの確執をコナンが読み解く一話。

列車内で起きた古典的トリックを駆使した殺人事件「列車トリック殺人事件」。鉄道時刻表と座席配置、車内アナウンスの時刻という古典ミステリー要素満載の一話。

人気バラエティ番組「おじゃマンボウ」の収録中に起きる殺人事件。テレビ番組ならではの台本進行と本物の事件の区別を、コナンが進行表から見抜く一話。

小五郎・蘭・コナンは「シャーロックホームズ・フリーク歓迎ツアー」に参加。ツアー主催者の金谷が車に乗ったまま崖から転落して炎上死する事故が発生。孤立した参加者たちは一室に閉じこもるが、第2の事故が起こる——ツアー参加者として居合わせた**服部平次と共に**、コナンが犯人との知恵比べを開始する前編。

「犯人の正体がわかった」と言い放った大木綾子がガレージで爆死し、藤沢俊明までもがアイスピックで襲われる。連続して起こる事件のトリックと、ホームズ・フリークたちが集まる場における暗号や引用の意味を、コナンと平次が東西から協力して解き明かす後編。

少年探偵団の初めてのお使いに絡む殺人事件。子どもたちのちょっとした冒険と大人の事件が交差する温かな構造をコナンが見守りつつ解決する一話。

イラストレーターのアトリエで起きた殺人事件「イラストレーター殺人事件」。画材・絵筆・キャンバスという創作の現場が事件の舞台になる初期回。

毛利一家とコナンが幽霊が出ると噂される古い洋館風の船に招かれる。集まったメンバーの中で次々と起こる不可解な現象と、ついに発生する殺人事件。「幽霊船」の伝説の真偽と現実の殺人事件が交錯する、初期の船舶ものミステリー前編。

船内で続く事件の真相が明らかになる解決編。「幽霊」を装って犯行を覆い隠そうとした犯人のトリックと、長年蓄積された動機が暴かれる。閉ざされた船という空間で繰り広げられる本格推理と、超常現象風の演出が組み合わさった初期の好編。

怪獣映画「大怪獣ゴメラ」の撮影や上映会で起きた事件。少年探偵団も大興奮の特撮要素と、その裏で進行する殺人事件をコナンが解決する初期エピソード。

指紋を巡るトリックを駆使した殺人事件「第3の指紋殺人事件」。複数の指紋が示す矛盾と、犯人が残した「第三の」指紋の意味を、コナンが鑑識学的に解き明かす本格回。

海の生き物を題材にした誘拐事件「カニとクジラ誘拐事件」。海洋生物の比喩が事件解決の暗号になっている、初期作品ならではの遊び心ある一話。

街灯のない暗い道で起きた殺人事件「暗闇の道殺人事件」。視界の利かない条件下で、コナンが音と気配を頼りに犯人の動きを推理する初期の一話。

舞台女優が殺害される事件「舞台女優殺人事件」。劇場の構造、衣装替えのタイミング、共演者との確執を、コナンが演劇的視点から読み解く一話。

阿笠博士が当てた伊豆のミステリーツアーに、コナン・蘭・小五郎が代理で参加する。趣向は、参加者の中に隠れた主催者が「闇の男爵（ナイトバロン）」に扮し、その正体を見破った人に賞品が贈られるというもの。ところが夜、ナイトバロンの扮装をした人物が転落して死亡してしまう。コナンの父・工藤優作の小説に登場する人物を題材にした、3部作の事件篇。

闇の男爵殺人事件の疑惑篇。転落死したのはツアー参加者の一人だった。事故に見える状況だったが、コナンは衣装の着せられ方の不自然さから他殺だと見抜く。被害者の部屋は内側からチェーンのかかった密室で、コナンは外側から施錠する手口を看破する。さらに蘭たちの前にナイトバロンが再び現れ、プールからは衣装が発見される。

怪盗キッド絡みのシリーズ「闇の男爵（ナイトバロン）殺人事件」の解決篇。コナンとキッドの初期の対決と、男爵を巡るミステリーの完結回。シリーズの定型を作った重要回。

ストーカー被害を巡る事件「ストーカー殺人事件」。被害者と加害者の関係性、つきまといの記録を、コナンが整理して真の動機に辿り着く重い一話。

三つ子が住む別荘で起きた殺人事件「三つ子別荘殺人事件」。瓜二つの三人を見分けるトリックと、本人たちにしか知り得ない癖を、コナンが慎重に観察する初期の名作。

少年探偵団は海で春日財閥の御曹司・輝彦と恋人の忍と知り合い、モーターボートに乗せてもらう。夕方、先に帰ったはずの忍の名前と「SOS」のメッセージが入ったペットボトルを拾った少年探偵団は、忍を捜して海辺の洞窟に入り込むが、満潮で洞窟が水没する危機に陥る。

謎の人物「死神陣内」を巡る連続事件「死神陣内殺人事件」。不気味な呼び名と、その人物の実在性、過去の経緯をコナンが追跡する初期の重厚な一話。

金融会社の社長が殺害される事件「金融会社社長殺人事件」。経済犯罪と人間関係の絡まりが、コナンの推理によって整理されていくビジネスミステリー。

鈴木家の家宝で米花博物館に展示されている黒真珠「漆黒の星(ブラックスター)」を狙い、園子の家に怪盗1412号こと怪盗キッドから予告状が届く。園子は小五郎に捜査を依頼し、暗号を解いたコナンはホテルの屋上でキッドと対面。決戦の舞台は豪華客船へ移る。怪盗キッド(黒羽快斗)のアニメ初登場回。

名家で連続して変死者が出る事件の前編「名家連続変死事件」。古い家系に纏わる呪いめいた話と、現代の犯行が結びつく構造をコナンが整理し始める。

名家連続変死事件・後編。コナンは古い家系図と家屋の構造、現在の住人たちの関係から、長く続く確執が現代の事件として顕在化した真相を解き明かす重厚な完結回。

銀行強盗が殺害される事件「銀行強盗殺人事件」。強盗グループ内部の裏切りと分け前を巡る抗争を、コナンが現金の動きと現場の状況から読み解く一話。

放浪する画家が殺害される事件「放浪画家殺人事件」。画家の足取りと残された作品の中に込められたメッセージを、コナンが芸術的視点と科学的視点の両方から検証する一話。

人気アーティストの誘拐事件・前編。芸能界の華やかさと裏側の駆け引き、ファンやスタッフの中に潜む犯人候補が浮かび上がる導入回。

人気アーティスト誘拐事件・後編。コナンはアーティストの活動歴と関係者の動機を結びつけ、誘拐の真の目的を暴く。エンタメ業界ミステリーの完結回。

総合病院で起きた殺人事件「総合病院殺人事件」。医療現場の慌ただしさと、医師・看護師・患者の関係性をコナンが整理し、医療知識を活かして真相に迫る一話。

スキーロッジで起きた殺人事件・前編「スキーロッジ殺人事件」。雪山という閉鎖空間で進行する事件と、ロッジの構造・宿泊客の動線が描かれる導入回。

スキーロッジ殺人事件・後編。コナンは雪上の足跡とロッジ内の暖房状況、スキー道具の状態から、犯人が「ロッジから出ていないフリ」をしたトリックを暴く完結回。